Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F3O00716 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F3O00716 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F3O00716 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F3O00716 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F3O00716 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F3O00716 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F3O00716 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F3O00716 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F3O00716 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F3O00716 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F3O00716 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F3O00716 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F3O00716 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F3O00716 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F3O00716 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F3O00716 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F3O00716 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F3O00716 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F3O00716 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F3O00716 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F3O00716 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F3O00716 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F3O00716 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F3O00716 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F3O00716 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F3O00716 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F3O00716 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F3O00716 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F3O00716 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F3O00716 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F3O00716 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F3O00716 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F3O00716 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F3O00716 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F3O00716 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F3O00716 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F3O00716 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F3O00716 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F3O00716 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F3O00716 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F3O00716 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F3O00716 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F3O00716 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F3O00716 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
E2F3O00716 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
E2F3O00716 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F3O00716 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F3O00716 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F3O00716 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F3O00716 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F3O00716 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F3O00716 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F3O00716 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F3O00716 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F3O00716 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F3O00716 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F3O00716 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F3O00716 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F3O00716 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F3O00716 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F3O00716 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F3O00716 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F3O00716 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F3O00716 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F3O00716 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F3O00716 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F3O00716 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F3O00716 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F3O00716 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F3O00716 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F3O00716 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F3O00716 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F3O00716 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F3O00716 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F3O00716 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F3O00716 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F3O00716 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F3O00716 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F3O00716 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F3O00716 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F3O00716 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F3O00716 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F3O00716 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F3O00716 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F3O00716 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F3O00716 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F3O00716 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F3O00716 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F3O00716 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F3O00716 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F3O00716 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F3O00716 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F3O00716 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F3O00716 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F3O00716 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F3O00716 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F3O00716 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F3O00716 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F3O00716 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms