Protein–RNA interactions for Protein: O00499

BIN1, Myc box-dependent-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN1O00499 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BIN1O00499 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BIN1O00499 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BIN1O00499 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BIN1O00499 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BIN1O00499 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BIN1O00499 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BIN1O00499 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BIN1O00499 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BIN1O00499 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BIN1O00499 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BIN1O00499 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BIN1O00499 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BIN1O00499 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BIN1O00499 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BIN1O00499 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BIN1O00499 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BIN1O00499 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BIN1O00499 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BIN1O00499 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BIN1O00499 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BIN1O00499 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BIN1O00499 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BIN1O00499 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BIN1O00499 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BIN1O00499 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BIN1O00499 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BIN1O00499 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BIN1O00499 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BIN1O00499 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BIN1O00499 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BIN1O00499 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BIN1O00499 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BIN1O00499 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BIN1O00499 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BIN1O00499 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BIN1O00499 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BIN1O00499 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BIN1O00499 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BIN1O00499 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BIN1O00499 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BIN1O00499 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BIN1O00499 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BIN1O00499 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BIN1O00499 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BIN1O00499 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BIN1O00499 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BIN1O00499 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BIN1O00499 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BIN1O00499 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BIN1O00499 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BIN1O00499 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BIN1O00499 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
BIN1O00499 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BIN1O00499 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BIN1O00499 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BIN1O00499 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BIN1O00499 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BIN1O00499 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BIN1O00499 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BIN1O00499 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BIN1O00499 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BIN1O00499 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BIN1O00499 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BIN1O00499 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BIN1O00499 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BIN1O00499 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BIN1O00499 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BIN1O00499 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BIN1O00499 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BIN1O00499 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BIN1O00499 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BIN1O00499 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BIN1O00499 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BIN1O00499 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BIN1O00499 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BIN1O00499 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BIN1O00499 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BIN1O00499 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BIN1O00499 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BIN1O00499 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BIN1O00499 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BIN1O00499 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BIN1O00499 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BIN1O00499 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BIN1O00499 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BIN1O00499 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BIN1O00499 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
BIN1O00499 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BIN1O00499 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BIN1O00499 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BIN1O00499 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BIN1O00499 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BIN1O00499 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BIN1O00499 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BIN1O00499 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BIN1O00499 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BIN1O00499 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BIN1O00499 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BIN1O00499 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms