Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PIK3C2AO00443 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
PIK3C2AO00443 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms