Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFKBIEO00221 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NFKBIEO00221 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms