Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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