Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NPIPB9F8W1W9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms