Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HACD1B0YJ81 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HACD1B0YJ81 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms