Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KNCNA6PVL3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KNCNA6PVL3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms