Protein–RNA interactions for Protein: A6NKC9

SH2D7, SH2 domain-containing protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D7A6NKC9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH2D7A6NKC9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH2D7A6NKC9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH2D7A6NKC9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SH2D7A6NKC9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH2D7A6NKC9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH2D7A6NKC9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH2D7A6NKC9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH2D7A6NKC9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH2D7A6NKC9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH2D7A6NKC9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH2D7A6NKC9 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH2D7A6NKC9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH2D7A6NKC9 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH2D7A6NKC9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms