Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6L9A6NEM1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms