Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms