Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCE3A1L190 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms