Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CCDC61Q9Y6R9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC61Q9Y6R9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms