Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q9

NCOA3, Nuclear receptor coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA3Q9Y6Q9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NCOA3Q9Y6Q9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NCOA3Q9Y6Q9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NCOA3Q9Y6Q9 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NCOA3Q9Y6Q9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NCOA3Q9Y6Q9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NCOA3Q9Y6Q9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NCOA3Q9Y6Q9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NCOA3Q9Y6Q9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NCOA3Q9Y6Q9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NCOA3Q9Y6Q9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC29■■■□□ 2.23
NCOA3Q9Y6Q9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NCOA3Q9Y6Q9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NCOA3Q9Y6Q9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NCOA3Q9Y6Q9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NCOA3Q9Y6Q9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NCOA3Q9Y6Q9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NCOA3Q9Y6Q9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
NCOA3Q9Y6Q9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NCOA3Q9Y6Q9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NCOA3Q9Y6Q9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NCOA3Q9Y6Q9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NCOA3Q9Y6Q9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NCOA3Q9Y6Q9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NCOA3Q9Y6Q9 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
NCOA3Q9Y6Q9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NCOA3Q9Y6Q9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
NCOA3Q9Y6Q9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NCOA3Q9Y6Q9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NCOA3Q9Y6Q9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NCOA3Q9Y6Q9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NCOA3Q9Y6Q9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NCOA3Q9Y6Q9 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NCOA3Q9Y6Q9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NCOA3Q9Y6Q9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NCOA3Q9Y6Q9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NCOA3Q9Y6Q9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NCOA3Q9Y6Q9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
NCOA3Q9Y6Q9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
NCOA3Q9Y6Q9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NCOA3Q9Y6Q9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NCOA3Q9Y6Q9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NCOA3Q9Y6Q9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms