Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN6Q9Y6Q1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms