Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAXBP1Q9Y5B6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAXBP1Q9Y5B6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms