Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
DCAF1Q9Y4B6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
DCAF1Q9Y4B6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
DCAF1Q9Y4B6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
DCAF1Q9Y4B6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
DCAF1Q9Y4B6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
DCAF1Q9Y4B6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
DCAF1Q9Y4B6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
DCAF1Q9Y4B6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
DCAF1Q9Y4B6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
DCAF1Q9Y4B6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
DCAF1Q9Y4B6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
DCAF1Q9Y4B6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
DCAF1Q9Y4B6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
DCAF1Q9Y4B6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
DCAF1Q9Y4B6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
DCAF1Q9Y4B6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC40.12■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC40.11■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC40.11■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC40.11■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC40.1■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC40.1■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC40.1■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC40.07■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
DCAF1Q9Y4B6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
DCAF1Q9Y4B6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4
DCAF1Q9Y4B6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4
DCAF1Q9Y4B6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
DCAF1Q9Y4B6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.06■■■■■ 4
DCAF1Q9Y4B6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC40.06■■■■■ 4
DCAF1Q9Y4B6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
DCAF1Q9Y4B6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC40.06■■■■■ 4
DCAF1Q9Y4B6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
DCAF1Q9Y4B6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
DCAF1Q9Y4B6 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC40.06■■■■■ 4
DCAF1Q9Y4B6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
DCAF1Q9Y4B6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
DCAF1Q9Y4B6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
DCAF1Q9Y4B6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
DCAF1Q9Y4B6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
DCAF1Q9Y4B6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
DCAF1Q9Y4B6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
DCAF1Q9Y4B6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
DCAF1Q9Y4B6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms