Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KIF3AQ9Y496 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIF3AQ9Y496 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms