Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAN1Q9Y2M0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAN1Q9Y2M0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAN1Q9Y2M0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAN1Q9Y2M0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAN1Q9Y2M0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAN1Q9Y2M0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAN1Q9Y2M0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAN1Q9Y2M0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAN1Q9Y2M0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAN1Q9Y2M0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAN1Q9Y2M0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAN1Q9Y2M0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAN1Q9Y2M0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FAN1Q9Y2M0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FAN1Q9Y2M0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAN1Q9Y2M0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FAN1Q9Y2M0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAN1Q9Y2M0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAN1Q9Y2M0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAN1Q9Y2M0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAN1Q9Y2M0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAN1Q9Y2M0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAN1Q9Y2M0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAN1Q9Y2M0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAN1Q9Y2M0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAN1Q9Y2M0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAN1Q9Y2M0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAN1Q9Y2M0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAN1Q9Y2M0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAN1Q9Y2M0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAN1Q9Y2M0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAN1Q9Y2M0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAN1Q9Y2M0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAN1Q9Y2M0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAN1Q9Y2M0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAN1Q9Y2M0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAN1Q9Y2M0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAN1Q9Y2M0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAN1Q9Y2M0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAN1Q9Y2M0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAN1Q9Y2M0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAN1Q9Y2M0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAN1Q9Y2M0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAN1Q9Y2M0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAN1Q9Y2M0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAN1Q9Y2M0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAN1Q9Y2M0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAN1Q9Y2M0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAN1Q9Y2M0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAN1Q9Y2M0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAN1Q9Y2M0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAN1Q9Y2M0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAN1Q9Y2M0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAN1Q9Y2M0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAN1Q9Y2M0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAN1Q9Y2M0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAN1Q9Y2M0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAN1Q9Y2M0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FAN1Q9Y2M0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FAN1Q9Y2M0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAN1Q9Y2M0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAN1Q9Y2M0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAN1Q9Y2M0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms