Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP20Q9Y2K6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP20Q9Y2K6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms