Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC4Q9Y296 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC4Q9Y296 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms