Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y210

TRPC6, Short transient receptor potential channel 6, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC6Q9Y210 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRPC6Q9Y210 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRPC6Q9Y210 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms