Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HDAC5Q9UQL6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HDAC5Q9UQL6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms