Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ52

CNTN6, Contactin-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN6Q9UQ52 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN6Q9UQ52 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN6Q9UQ52 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms