Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
IGSF9BQ9UPX0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IGSF9BQ9UPX0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGSF9BQ9UPX0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms