Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR5

SLC8A2, Sodium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A2Q9UPR5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC8A2Q9UPR5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC8A2Q9UPR5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC8A2Q9UPR5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC8A2Q9UPR5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC8A2Q9UPR5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms