Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
L1RE1Q9UN81 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms