Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS5

PHTF1, Putative homeodomain transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF1Q9UMS5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PHTF1Q9UMS5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHTF1Q9UMS5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms