Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAPPC2LQ9UL33 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms