Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AMFRQ9UKV5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AMFRQ9UKV5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms