Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HDAC9Q9UKV0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC9Q9UKV0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms