Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF3C4Q9UKN8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms