Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKB1

FBXW11, F-box/WD repeat-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW11Q9UKB1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXW11Q9UKB1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXW11Q9UKB1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXW11Q9UKB1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXW11Q9UKB1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXW11Q9UKB1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXW11Q9UKB1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXW11Q9UKB1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXW11Q9UKB1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXW11Q9UKB1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXW11Q9UKB1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXW11Q9UKB1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXW11Q9UKB1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXW11Q9UKB1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXW11Q9UKB1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXW11Q9UKB1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXW11Q9UKB1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXW11Q9UKB1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms