Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GGA1Q9UJY5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GGA1Q9UJY5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms