Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHORDC1Q9UHD1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms