Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGXB4Q9UGU5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGXB4Q9UGU5 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms