Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNA9Q9UGM1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms