Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
COPS7AQ9UBW8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COPS7AQ9UBW8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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