Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM8A1Q9UBU6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM8A1Q9UBU6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM8A1Q9UBU6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM8A1Q9UBU6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM8A1Q9UBU6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM8A1Q9UBU6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms