Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHD7Q9P2D1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHD7Q9P2D1 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms