Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC42.97■■■■■ 4.47
CCDC180Q9P1Z9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC42.97■■■■■ 4.47
CCDC180Q9P1Z9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
CCDC180Q9P1Z9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC42.97■■■■■ 4.47
CCDC180Q9P1Z9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.97■■■■■ 4.47
CCDC180Q9P1Z9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
CCDC180Q9P1Z9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC42.97■■■■■ 4.47
CCDC180Q9P1Z9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC42.97■■■■■ 4.47
CCDC180Q9P1Z9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
CCDC180Q9P1Z9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.96■■■■■ 4.47
CCDC180Q9P1Z9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
CCDC180Q9P1Z9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC42.95■■■■■ 4.47
CCDC180Q9P1Z9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC42.95■■■■■ 4.47
CCDC180Q9P1Z9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC42.95■■■■■ 4.47
CCDC180Q9P1Z9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC42.95■■■■■ 4.47
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
CCDC180Q9P1Z9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC42.95■■■■■ 4.47
CCDC180Q9P1Z9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
CCDC180Q9P1Z9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC42.94■■■■■ 4.47
CCDC180Q9P1Z9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.47
CCDC180Q9P1Z9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.47
CCDC180Q9P1Z9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
CCDC180Q9P1Z9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
CCDC180Q9P1Z9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.94■■■■■ 4.46
CCDC180Q9P1Z9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
CCDC180Q9P1Z9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.94■■■■■ 4.46
CCDC180Q9P1Z9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
CCDC180Q9P1Z9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
CCDC180Q9P1Z9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
CCDC180Q9P1Z9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
CCDC180Q9P1Z9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
CCDC180Q9P1Z9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
CCDC180Q9P1Z9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
CCDC180Q9P1Z9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
CCDC180Q9P1Z9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
CCDC180Q9P1Z9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC42.93■■■■■ 4.46
CCDC180Q9P1Z9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC42.93■■■■■ 4.46
CCDC180Q9P1Z9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC42.93■■■■■ 4.46
CCDC180Q9P1Z9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC42.93■■■■■ 4.46
CCDC180Q9P1Z9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC42.92■■■■■ 4.46
CCDC180Q9P1Z9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
CCDC180Q9P1Z9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.92■■■■■ 4.46
CCDC180Q9P1Z9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.92■■■■■ 4.46
CCDC180Q9P1Z9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC42.92■■■■■ 4.46
CCDC180Q9P1Z9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC42.92■■■■■ 4.46
CCDC180Q9P1Z9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
CCDC180Q9P1Z9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
CCDC180Q9P1Z9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
CCDC180Q9P1Z9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
CCDC180Q9P1Z9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC42.92■■■■■ 4.46
CCDC180Q9P1Z9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC42.91■■■■■ 4.46
CCDC180Q9P1Z9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
CCDC180Q9P1Z9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC42.91■■■■■ 4.46
CCDC180Q9P1Z9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC42.91■■■■■ 4.46
CCDC180Q9P1Z9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC42.91■■■■■ 4.46
CCDC180Q9P1Z9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
CCDC180Q9P1Z9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
CCDC180Q9P1Z9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
CCDC180Q9P1Z9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC42.91■■■■■ 4.46
CCDC180Q9P1Z9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
CCDC180Q9P1Z9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC42.9■■■■■ 4.46
CCDC180Q9P1Z9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.9■■■■■ 4.46
CCDC180Q9P1Z9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC42.9■■■■■ 4.46
CCDC180Q9P1Z9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
CCDC180Q9P1Z9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
CCDC180Q9P1Z9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC42.89■■■■■ 4.46
CCDC180Q9P1Z9 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.89■■■■■ 4.46
CCDC180Q9P1Z9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC42.89■■■■■ 4.46
CCDC180Q9P1Z9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC42.89■■■■■ 4.46
CCDC180Q9P1Z9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
CCDC180Q9P1Z9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.88■■■■■ 4.46
CCDC180Q9P1Z9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC42.88■■■■■ 4.46
CCDC180Q9P1Z9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC42.88■■■■■ 4.46
CCDC180Q9P1Z9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
CCDC180Q9P1Z9 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
CCDC180Q9P1Z9 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
CCDC180Q9P1Z9 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
CCDC180Q9P1Z9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC42.88■■■■■ 4.45
CCDC180Q9P1Z9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC42.88■■■■■ 4.45
CCDC180Q9P1Z9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
CCDC180Q9P1Z9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.88■■■■■ 4.45
CCDC180Q9P1Z9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
CCDC180Q9P1Z9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
CCDC180Q9P1Z9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
CCDC180Q9P1Z9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
CCDC180Q9P1Z9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC42.88■■■■■ 4.45
CCDC180Q9P1Z9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
CCDC180Q9P1Z9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
CCDC180Q9P1Z9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
CCDC180Q9P1Z9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC42.87■■■■■ 4.45
CCDC180Q9P1Z9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC42.87■■■■■ 4.45
CCDC180Q9P1Z9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
CCDC180Q9P1Z9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.87■■■■■ 4.45
CCDC180Q9P1Z9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC42.86■■■■■ 4.45
CCDC180Q9P1Z9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
CCDC180Q9P1Z9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC42.86■■■■■ 4.45
CCDC180Q9P1Z9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.86■■■■■ 4.45
CCDC180Q9P1Z9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC42.86■■■■■ 4.45
CCDC180Q9P1Z9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
CCDC180Q9P1Z9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.86■■■■■ 4.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms