Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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SH3BP4Q9P0V3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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SH3BP4Q9P0V3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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SH3BP4Q9P0V3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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SH3BP4Q9P0V3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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SH3BP4Q9P0V3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SH3BP4Q9P0V3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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