Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXXC1Q9P0U4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXXC1Q9P0U4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms