Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

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Length 651 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RRN3Q9NYV6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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