Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA4

MTMR4, Myotubularin-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR4Q9NYA4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MTMR4Q9NYA4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTMR4Q9NYA4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms