Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDAP2Q9NXN4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GDAP2Q9NXN4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms