Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX61

TMEM161A, Transmembrane protein 161A, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM161AQ9NX61 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM161AQ9NX61 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM161AQ9NX61 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM161AQ9NX61 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM161AQ9NX61 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM161AQ9NX61 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM161AQ9NX61 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM161AQ9NX61 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM161AQ9NX61 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM161AQ9NX61 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM161AQ9NX61 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM161AQ9NX61 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM161AQ9NX61 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM161AQ9NX61 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms