Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TDP1Q9NUW8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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