Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTLC3Q9NUV7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms