Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUS5

AP5S1, AP-5 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5S1Q9NUS5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5S1Q9NUS5 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5S1Q9NUS5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5S1Q9NUS5 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5S1Q9NUS5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5S1Q9NUS5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5S1Q9NUS5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5S1Q9NUS5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5S1Q9NUS5 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5S1Q9NUS5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5S1Q9NUS5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5S1Q9NUS5 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5S1Q9NUS5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5S1Q9NUS5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5S1Q9NUS5 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5S1Q9NUS5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5S1Q9NUS5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5S1Q9NUS5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5S1Q9NUS5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5S1Q9NUS5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5S1Q9NUS5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5S1Q9NUS5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5S1Q9NUS5 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5S1Q9NUS5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5S1Q9NUS5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5S1Q9NUS5 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5S1Q9NUS5 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5S1Q9NUS5 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP5S1Q9NUS5 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP5S1Q9NUS5 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP5S1Q9NUS5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP5S1Q9NUS5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP5S1Q9NUS5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP5S1Q9NUS5 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP5S1Q9NUS5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP5S1Q9NUS5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP5S1Q9NUS5 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP5S1Q9NUS5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP5S1Q9NUS5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP5S1Q9NUS5 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP5S1Q9NUS5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms